纳米抗体筛选
基于酵母表面展示的纳米抗体筛选 (Q&A)
什么是纳米抗体?它的用途是什么?
只由重链可变区组成的单域抗体,称为纳米抗体(Nanobody),又称VHH。分子量15kD左右,是自然存在最小的功能性抗原结合片段。
与传统抗体相比,具有更高的亲和力与稳定性、容易制备、免疫原性低、可溶性好、穿透力强等特性。在癌症、自身免疫病、呼吸系统疾病、血液系统疾具备独特的开发应用价值。
酵母表面展示的原理是什么?
该酿酒酵母表面展示使用α-凝集素系统,α-凝集素由2个核心亚单位Aga1和Aga2组成。在此系统中,编码Aga1蛋白的基因稳定地整合到酵母染色体中,而Aga2克隆到环状酵母展示质粒载体中。在半乳糖诱导表达后,Aga1锚定在细胞壁上,外源蛋白和Aga2融合表达,在信号肽的引导下分泌表达,Aga2通过两个二硫键与α-凝集素Aga1蛋白共价连接形成共价复合物,以这种方式实现目的蛋白的细胞表面展示。

使用什么文库进行筛选?
我们使用nanobody的全合成文库,酵母菌株为Saccharomyces cerevisiae EBY100,展示质粒为pYDS649,文库大小约 5.6×10⁸.
使用什么筛选方法?
我们使用磁珠分选(MACS)和流式分选(FACS)相结合的方法来筛选纳米抗体。
筛选的纳米抗体和抗原蛋白的亲和力有多高?
一般情况下,纳米抗体和抗原的亲和力可以达到nM。
需要准备多少抗原蛋白用于筛选实验?
以50 kD蛋白为例,MACS和FACS大约需要0.5mg蛋白。分子筛和SPR所需抗原蛋白量和需要验证的纳米抗体的数量有关,每个nanobody的验证大约需要0.3mg抗原蛋白。
抗原蛋白需要做什么标记?
用于MACS和FACS的抗原蛋白,可选择做FITC标记、生物素化标记,或带Flag标签等。
用于分子筛和SPR结合验证的抗原蛋白,无需特殊标记。
筛选周期需要多长时间?
一般需要2.5-3个月(包含分选,nanobody质粒合成、蛋白纯化,结合验证等)。
筛选流程示意图

筛选设备和仪器
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磁珠分选
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流式分选
案例展示
流式分选结果
分子筛和SPR验证
Nanobody辅助电镜结构
膜蛋白nanobody