结构生物学


结构生物学是佰翱得的核心优势。在这里,我们结合多种技术进行结构研究,包括X射线晶体学和冷冻电镜Cryo-EM。我们不仅能提供基于蛋白结构的药物发现服务和基于小分子片段的药物发现,而且还能解析膜蛋白,大的蛋白复合物,以及进行抗原表位鉴定等复杂项目。
 
佰翱得不断努力提供及时,准确和高质量的结构数据,这使我们成为许多全球制药公司基于结构的药物设计(SBDD)服务的优选合作伙伴之一。我们的晶体学团队已经交付了2000多个晶体结构,而cryoEM团队还为客户提供了十几个高分辨率结构。
 

此外,佰翱得的microED服务可以帮助客户鉴定样品中微晶体的结构和晶型,此技术可应用于小分子化合物,多肽以及蛋白等多种类型的样品。 

 

展示案例:通过X射线结构和cryo-EM进行抗原决定簇定位

高分辨率的抗原表位结构不仅可以帮助研究人员优化抗体药物,而且还能为专利研发提供强有力的直观数据支持。在许多研究抗原表位结构的方法中,晶体衍射和冷冻电镜将是较好选择。完全具备这两项前沿技术的佰翱得结构平台势必为广大客户提供这方面专业的服务。

 

晶体衍射技术结构在决定抗原表位

应用:
  • 高分辨率质量的抗体决定簇结构信息(分辨率高于3.0A)
  • 专利申请和实体化
  • 药物抗体优化
 
产品特征:
  • 成熟的方法(黄金标准)
  • 标准化工作流程
  • 高分辨率
 
工作流程:

 

实验

时间

交付成果

抗原抗体制备

时间依项目而定

抗原抗体(纯度>90%)

抗体预处理

1- 2周

抗体(纯度>90%)

抗原Fab复合物晶体

2- 4周

适合衍射的单晶体大小

X衍射数据收集

2-4周

高分辨率结构(<3.0A)

复杂结构的确定

1-2周

精细抗原结构表位

 
案例分析:
  • 抗原/抗体处理
  • 晶体培养/优化
  • 数据采集
  • 结构解析
  • 测定抗原表位

 

Biortus

 

冷冻电镜技术决定抗原表位

应用:
  • 抗体筛选
  • 代替结晶快速获得结构的方法
 
产品特征:
  • 比晶体更快速的获得样品的结构
  • 样品直接成像
  • 对较大的蛋白质及复合物非常有用
  • 3.5A以上的分辨率
 
工作流程:

 

实验

时间

交付成果

抗原、抗体制备

依项目而定

抗原抗体(纯度>90)

抗原Fab复合物制备

1天

负染照片

样品检测,制备和数据收集

2-8周

冷冻电镜照片

数据处理和3D重构

4-10周

高分辨率的结构以及原子模型

 
案例分析(手足口病病毒CVA6抗原表位的原子结构针对病毒衣壳蛋白的抗原片段)
  • 电子显微成像
  • 三维电子密度图 (3.8A)
  • 抗原抗体与电子图的密度匹配
  • 测定抗原表位

Biortus

发表于(自然通讯)杂志的手足口病病毒CVA6杭原抗体复合物的近原子分情率结构。佰翱得冷电镜平台负责人颜晓东为通讯作者之一