蛋白质设计


蛋白质设计通过合理设计新的蛋白质分子,优化蛋白的活性、行为,来促进对蛋白质功能的基本理解。蛋白质设计按设计目的不同,可以分为蛋白质结构设计和蛋白质功能设计。蛋白质结构设计又分为蛋白质结构从头设计和蛋白质结构改造两种类型。 合理的蛋白质设计方法首先进行蛋白质序列预测,将其折叠成特定结构。 然后可以通过肽合成、定点诱变或人工基因合成等方法对这些预测序列进行实验验证。 蛋白质设计包括酶设计、亲和力设计、特异性设计、膜蛋白设计等。蛋白改造可以通过蛋白质核心或蛋白质表面的改造以提高蛋白质的热稳定性,通过结构域改造来实现蛋白质的小型化,通过蛋白质拓扑结构的再设计来实现酶的小型化等。

 

华盛顿大学David Baker教授是蛋白设计领域的领军人物,作为计算建模和蛋白质结构分析软件Rosetta的开发者,他设计了一系列具有重要生理意义的蛋白,其中包括IL2和 IL15受体的激动蛋白,异源相互作用蛋白,多次跨膜蛋白,蛋白纤维等。佰翱得计算结构团队致力于借鉴和学习先进的蛋白设计理念和方法,为客户提供优质的解决方案。